Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKAP1Q86WV1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKAP1Q86WV1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms