Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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