Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5Q1

CPEB2, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB2Q7Z5Q1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CPEB2Q7Z5Q1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CPEB2Q7Z5Q1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms