Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STRCQ7RTU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms