Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTF1AQ7RTS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms