Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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USP43Q70EL4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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