Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM43BQ6ZT52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM43BQ6ZT52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms