Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC9Q6ZRR7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC9Q6ZRR7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms