Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00322Q6ZN03 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00322Q6ZN03 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms