Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNE3Q6ZMZ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNE3Q6ZMZ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE3Q6ZMZ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE3Q6ZMZ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNE3Q6ZMZ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms