Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM72Q6ZMU5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM72Q6ZMU5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms