Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF7IPQ6VMQ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF7IPQ6VMQ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF7IPQ6VMQ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF7IPQ6VMQ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms