Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG3Q6UXM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRIG3Q6UXM1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms