Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C16orf54Q6UWD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms