Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMARCD3Q6STE5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms