Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUX4L9Q6RFH8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms