Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF2Q6PJF5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms