Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms