Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6P435 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6P435 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6P435 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6P435 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6P435 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6P435 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms