Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3HQ6NTF7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3HQ6NTF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC3HQ6NTF7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms