Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCSAPQ6IQ19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCSAPQ6IQ19 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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