Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CARMIL1Q5VZK9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL1Q5VZK9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms