Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD13Q5VXD3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms