Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BROXQ5VW32 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms