Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC30Q5VVM6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms