Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRNL1Q5VV63 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms