Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF4Q5VUM1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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