Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1TD1Q5T7N2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1TD1Q5T7N2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms