Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3LQ5T215 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms