Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHYHD1Q5SRE7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms