Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZD11Q5EBL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms