Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC178Q5BJE1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC178Q5BJE1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms