Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q56UQ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q56UQ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q56UQ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q56UQ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q56UQ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q56UQ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q56UQ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q56UQ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q56UQ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q56UQ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q56UQ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms