Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COBLL1Q53SF7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms