Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SBK1Q52WX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SBK1Q52WX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms