Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms