Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms