Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms