Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL40Q2TBA0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms