Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC27Q2M243 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC27Q2M243 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms