Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RTL8BQ17RB0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RTL8BQ17RB0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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