Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLPPQ16740 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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