Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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NRF1Q16656 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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NRF1Q16656 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRF1Q16656 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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