Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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