Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDB1Q16531 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms