Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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