Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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