Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF56Q15929 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms