Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX1Q15699 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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