Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM1Q15629 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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